咳嗽的时候嗓子疼有以下情况：
1.咳嗽的时候导致咽喉部的肌肉，比如咽缩肌出现拉伤，咳嗽的时候容易导致咽喉部黏膜出现撕裂，以上情况出现后会导致出现嗓子疼的表现。尤其是咳嗽时间长、咳嗽剧烈、咳嗽幅度大的时候，上述情况更加容易出现。
2.长期反复咳嗽容易诱发咽喉部黏膜充血，诱发出现扁桃体发炎。一旦有咽喉炎、扁桃体炎等，剧烈咳嗽的时候容易加重局部炎症刺激，诱发出现咽喉部疼痛感。扁桃体炎、咽喉炎越严重的时候，疼痛感越加明显。
总之，咳嗽时嗓子疼，建议上耳鼻喉科以及呼吸内科进行系统治疗。