肛周脓肿引流后还是有可能会出现复发的，特别是肛周脓肿行单纯引流术后，术中没有寻找肛周脓肿的内口，并且处理内口。
当术后肛门周围的引流口完全愈合以后，由于内口的存在，直肠内的粪水以及细菌会通过内口进入原来脓腔的位置，从而引发再次出现感染，感染以后会导致脓液形成，从而导致肛周脓肿复发。
复发脓肿的脓液会经原手术引流口破出，局部症状也会迅速缓解。后期还会反复的出现肛门周围肿痛以及流脓症状，此时肛周脓肿已经发展成为肛瘘，需要再次手术治疗，才能够完全治愈。