直肠炎和结肠炎最本质的区别就是发生部位不同，直肠炎是指发生于直肠的肠道炎症性疾病，而结肠炎就是指发生于结肠的肠道炎症性疾病。
由于发生部位的不同，所以引起的临床症状可能会有所区别。对于结肠炎可能会表现为腹痛、腹泻、黏液便，有些会伴有便血或者黏液血便，颜色大多呈暗红色。而直肠炎会表现为明显的直肠刺激症状，例如患者会出现大便次数增多、里急后重、黏液血便等，出血颜色相对结肠炎引发的出血会更鲜红一点。
直肠和结肠均属于大肠，而直肠距离肛门更近，一般是距离肛门9~12cm的大肠称之为直肠，而直肠近端的大肠就称为结肠。