早上醒来后肚子不舒服，首先要考虑是夜间腹部受凉所导致的不适症状，可以通过按摩、热敷等方式，看能不能缓解不适的症状。
如果经常在早上醒来后肚子不舒服，要警惕是十二指肠溃疡引起的症状。十二指肠溃疡最明显的症状就是空腹状态下疼痛不适，吃完东西后腹部不适的症状会有所减轻。
如果在头天晚上暴饮暴食，吃了一些油腻、辛辣的食物，也会导致第二天早上肚子不舒服，是因为消化不良造成。建议先喝点温热水，再适当吃点早餐，然后观察一下不适症状是否缓解。必要时去医院检查。