肠外结核的症状一般表现为全身症状，患者临床症状轻重不一，常表现为发热，多以午后低热为主，患者常于午后或夜间开始体温上升，到晨起体温可以降至正常，热型多为不规则发热。
除了发热，患者还会有乏力、盗汗等症状。患者会营养状态较差，出现贫血，维生素缺乏、面色苍白、消瘦等症状。
肠结核可以出现肠道症状和肠外症状，如果一旦经病理或者影像学确诊为肠结核，要尽快地抗结核治疗，要达到足疗程，以实现结核的根治。