起床后出现咳嗽，可能与上呼吸道感染有关，其中包括鼻炎。
由于鼻腔分泌物大量增加，咽喉部位会因此受到刺激，早上起床之后可因体位变化引起刺激性咳嗽。另外，咽炎也会出现这种情况，由于咽喉部位存在发炎、肿胀，异物感也会使咽部受到刺激，所以早上起床后也会出现咳嗽。也常见于支气管炎的患者，特别是老年人，夜间睡觉时排痰能力下降，气道当中储存着大量痰液，会使气道受到刺激，早上起床后也会引发咳嗽。
除此之外，肺脓肿、肺结核等肺部疾病，同样会在空洞性病变的影响下，受到脓液、痰液、血液刺激，从而引发咳嗽。