藿香正气水对于胃肠型感冒的治疗具有较好的疗效。
胃肠型感冒与普通感冒不同，主要是由于柯萨奇病毒入侵所引起，同时还合并细菌感染，往往呼吸道的症状并不是很明显。主要表现为恶心、呕吐，以及腹痛、腹泻等胃肠道反应，大便可呈水样，甚至一天可多达十余次，严重时还可引起水电解质紊乱。
而藿香正气水具有缓解脘腹胀痛和呕吐泄泻的功效，适合胃肠型感冒患者服用。除此以外，藿香正气水当中含有酒精的成分，不能和头孢类等药物同时使用。