人体的生长发育主要是由激素调控的，所以内分泌失调会严重影响人的身高水平，所以身高异常多发生于内分泌疾病的患者，可以引起身高过于矮小，也可以导致身高过高，引起身高矮小的内分泌失调多见于幼年时甲减，可以导致呆小症的情况，患者的智力也会同时受到影响。
另外幼年时生长激素分泌过少，可以导致侏儒症，这种情况一般仅仅影响身高，不影响智力发育。
如果幼年时出现生长激素分泌过多，则会导致身高增长过快，从而导致巨人症等疾病。
还有一些特纳综合征、染色体疾病、一些综合症都可以影响身高。