肺脓肿的治疗，首选抗感染治疗，若肺脓肿严重，治疗效果不佳时，可以行支气管镜治疗。
支气管镜可以帮助明确肺脓肿的病因，在促进脓液和痰液引流的同时，还可以局部给药，有利于肺脓肿的治疗。肺脓肿是由感染引起的肺组织局部变性坏死，形成空腔和脓液。因此抗感染治疗是对脓肿治疗最重要的方式，根据药敏结果选择敏感的抗生素。对于脓腔较大的患者，可以行脓腔穿刺引流，必要时手术治疗。
在饮食上要多进食优质蛋白的食物，增强机体抵抗力。