肺结节是否需要抗生素治疗与引起的病因有关。引起肺结节的病因有很多，并不是所有的肺结节都需要使用抗生素治疗，部分肺结节的患者使用抗生素治疗也是无效。
临床上通常对于由细菌感染引起的肺结节，才需要视情况使用抗生素治疗。但对于由感染性因素引起的肺结节，更多的是由结核分枝杆菌或真菌感染而引起。此类感染性结节也不需要使用抗生素，而是使用抗结核药物或抗真菌药物的治疗。
此外，由非感染性因素引起的肺结节，亦不需要使用抗生素治疗。例如肺癌的患者视病情予以抗肿瘤或手术的治疗。故当发现肺结节时不要盲目的使用抗生素，要针对病因治疗。