胎儿在宫内缺氧，出生时难产窒息或者出生以后患病引起来的呼吸暂停，引起脑血流减少或者暂停，引起一系列的脑损伤。
如果慢性缺氧，机体会有代偿性的重新分配。先保证重要脏器的血液供应。但是如果缺氧时间比较长，代偿机制就不能正常地发挥作用，二次血流分配给脑组织重要部，位基底节、神经节、脑干、丘脑和小脑的血供应。
如果是急性缺氧，基底节、神经节代谢旺盛的脑组织更容易受损伤。因为缺氧脑组织的能量供应不足，衰竭，出现一系列神经元的水肿，凋亡或者坏死，临床上表现为患儿出现意识肌张力和原始反射的改变。