卵巢囊肿手术危不危险，需要看哪种手术采用的哪一种手术方式，以及卵巢囊肿手术的病理类型，以及具体详细的手术范围综合进行评估。
如果是炎性的卵巢囊肿或者是生理性的卵巢囊肿，一般手术采取腹腔镜切除囊肿即可，不会对周围组织造成太大的破坏，危险性也不是很高，所存在的危险性只是出血、感染以及麻醉的相关风险。如果卵巢囊肿性质不是很明确，属于一些交界性的肿物，或者不能明确性质的畸胎瘤以及卵巢上的其它病变，风险性就会增加。
在手术过程中需要做卵巢囊肿冰冻病理来明确性质，手术过程中选择合适的手术范围，如果是恶性则需要扩大手术范围，这样相比较生理性囊肿而言，风险就会明显增高，患者的手术时长也会延长，发生出血、感染以及各种并发症的几率也会增高。