肛乳头肥大并不需要使用药物。如有肛乳头肥大同时伴有其他肛管慢性炎症性疾病的情况下，就需要使用一些药物控制肛管慢性炎症性疾病，防止肛乳头肥大继续加重。因为肛乳头肥大是由于肛乳头受慢性炎症的刺激而导致的纤维增生。
例如伴有肛窦炎症时，可以使用一些抗生素的栓剂来控制肛窦的炎症。还有如果伴有肛裂时，可以使用痔疮栓或者外用痔疮膏，促使肛裂裂口愈合，消除炎症的刺激。
另外，患者还需要注意清淡饮食，避免摄入辛辣刺激性的食物，保持排便通畅，防止便秘，便后注意肛门局部清洁卫生。