胃溃疡肠胃炎的患者，一般需要应用4~6周抑制胃酸的药物。部分患者需要8周，以及6~8周的胃黏膜保护剂。
如果患者是合并幽门螺杆菌感染，需要根除幽门螺杆菌治疗。根除幽门螺杆菌治疗，一般是两周方案，可以选用含有铋剂和敏感抗生素的四联药物治疗。治疗结束后一个月，要复查呼气试验判断有没有根除成功。
胃溃疡肠胃炎患者除了应用药物外，还需要注意休息，减轻精神压力，不要过度紧张；停用没有必要吃的解热镇痛药，比如阿司匹林；建立良好的饮食习惯，不要暴饮暴食；要戒烟、戒酒，少喝浓咖啡和浓茶；定期复查电子胃镜。