电子肠镜能检查出部分肛周疾病，肛周疾病的诊断还需要依靠专科医生的查体以及彩超等辅助检查项目。
电子肠镜是将一个连有摄像头的管道，从肛门进入肠腔内，到达结肠回盲部后，边退边观察肠壁的病变。临床上主要用来诊断结、直肠疾病，如结、直肠炎症，息肉及肿瘤等疾病。
绝大多数的肛周疾病并不需要结肠镜来诊断，而是依靠专科医生的查体就可以明确诊断。但部分先天性肛门或者肠道畸形等比较复杂的肛周疾病，有时也需要依靠肠镜来判断分型，从而确定治疗方案。