小儿黏多糖贮积症的症状可表现在全身器官上，由于病情轻重不同，所以小儿会有不同的症状出现。
大多数小儿会出现智力发育落后的情况，部分小儿的身材一般比较矮小，还会有特殊的面容，小儿的表情比较淡漠、头相对比较大、面部比较丑陋、双眼距离比较宽、鼻梁出现低平、鼻孔大、嘴唇厚、前额和双侧的颧骨突出、毛发多但是发际低、脖子比较短。
小儿出现关节的畸形、胸廓也畸形，脊柱向后凸或向侧凸、膝盖外翻、手形像鸡爪。早期就会出现肝脾肿大、耳聋、心脏增大等症状。