胃肠功能紊乱的主要原因有以下三点：
1.饮食方面。在日常生活中，患者不注意饮食搭配结构，再加上暴饮暴食或是经常食用夜宵，这样就很可能给胃部造成不必要的负担，最终导致胃肠功能紊乱的出现。
2.病理导致。胃肠功能紊乱，其中也包括腹胀、腹泻、消化不良以及食欲不振等。当患者出现以上几种症状时，没有得到很好的调理和治疗，最终就会演变成胃肠功能紊乱的现象。
3.心理因素。有些患者出现此症状，不排除是工作方面或生活方面造成的压力而引起，但当情绪得到一定释放时，此症状也会明显消退。