肛瘘一个外口经常流脓，如果没有明显的疼痛及肿胀不适，说明肛瘘处于慢性感染期，因外口引流通畅，所以没有疼痛及肿胀不适感。
可进行抗感染治疗，口服或静滴抗感染药物。也可进行手术治疗，行肛瘘切除术或肛瘘挂线术，术中注意将内口寻找到并处理好，彻底将瘘管及外口处的坏死组织去除，术后很快就会愈合，肛瘘不会再反复发作。
但如果有外口处流脓的情况，而且患者感肛门周围疼痛、肿胀不适，考虑是感染发作期，首先考虑行手术治疗，以防感染控制不佳，导致形成新的脓肿。