呼吸不均匀的原因比较多，比较常见的包括睡眠呼吸暂停低通气综合征。由于夜间可能会发生反复的呼吸暂停，所以会表现为呼吸不均匀的现象。另外，这种情况也见于上呼吸道感染、支气管炎。此外也不排除是支气管哮喘导致，这些疾病都有可能会导致气管狭窄、呼吸不流畅，会表现为呼吸不均匀。
如果精神过度紧张也会出现呼吸不均匀，通常不会对身体造成影响，属于一种功能性损害，情绪恢复平稳后症状会自然解除。呼吸衰竭也会出现呼吸不均匀，提示病情较重，应当及时采取相关治疗。