肛门疼得厉害，首先需要及时去医院找肛肠科医生就诊，明确引起疼痛的原因再根据疾病的诊断采取相应的治疗方式，其治疗方式包括用药保守治疗以及手术治疗。肛门疼得厉害，在临床上最常见的原因有以下3个：
1.痔疮。多数是由于痔疮出现循环障碍所导致，例如痔疮突出伴嵌顿或者局部血栓形成炎性水肿等。轻症的可以通过使用药物缓解症状，包括口服改善循环的药物，例如地奥司明，以及外用痔疮膏、消肿止痛的药物坐浴等，大多一周左右症状就能缓解，严重的需要行手术治疗。
2.肛周脓肿。是由于肛腺感染所导致的肛管直肠周围间隙内出现化脓性的感染，会表现为肛门周围剧烈的疼痛症状，需要及时行手术将脓肿切开引流。
3.陈旧性肛裂。陈旧性肛裂导致的肛门疼痛多数和排便有关，一般发生在排便时以及排便后，肛门局部可看到肛裂的裂口，多数的陈旧性肛裂，也需要通过手术才能完全治愈。