大便的时候肛门发生了疼痛，建议患者先到正规医疗机构的肛肠科进行检查，一般通过肛门局部望诊、肛门指检、肛门镜的检查就可以初步明确诊断。
大便时肛门疼痛最常见的原因就是有肛裂的存在，就是在肛管直肠皮肤的位置形成了破口，破口在排便的时候受到粪便的影响，会出现疼痛。尤其是陈旧性的肛裂，肛门括约肌外露，在干硬粪块的刺激下，会出现剧烈的疼痛，表现为刀割样或者是撕裂样的疼痛。
另外，大便时肛门疼痛也要排除，是不是由于内痔的部分发生了脱出形成了缺血或者是由于外痔有水肿、血栓发炎的情况。另外，排除是不是有肛门周围脓肿的存在，肛门周围脓肿在排便时会出现鼓胀样的疼痛。