早上咳嗽厉害的原因比较多，首先考虑是支气管炎，可因季节变化、长期吸烟、感染等各种各样的内外因素诱发。除了咳嗽以外，还会伴有喘息、胸闷、咳痰、气促等现象。由于夜间睡觉时痰液在气道大量堆积，所以会出现早上咳嗽厉害的现象。
也可能是慢性咽炎，除了咳嗽以外，还会出现咽部异物感，甚至在刷牙时还会伴有干呕等症状，可由外界环境因素刺激或者细菌、病毒感染而诱发。
肺炎也会出现这种症状，提示存在过敏反应、放射损伤、病原微生物感染等，夜间平躺时肺部会分泌大量痰液，涌入到上呼吸道，使咽部受到刺激，所以起床后会出现剧烈咳嗽，以此排出呼吸道分泌物。