食管梅毒也是属于梅毒螺旋体感染所引起的一种疾病，所以在治疗的药物上仍然首选青霉素类药物治疗为主，尤其是长效青霉素制剂治疗效果比较好。
但是如果患者对青霉素过敏的情况下，可以选择使用大环内酯类抗生素，一般选用红霉素进行治疗，也可以使用四环素来进行治疗。
但是在患者出现有食管梅毒引起的狭窄病情发生时，可以选择进行食管球囊扩张术治疗，在食管球囊扩张术治疗效果不佳的情况下，也可以进行外科手术治疗，需要根据患者的病情来选择合适的治疗方案。