如果正常的月经周期出现孕酮低，说明是排卵不正常引起的，可以表现为月经时间延长或者是不规则的阴道出血，这时主要是口服黄体酮或者是地屈孕酮进行补充。
如果是在怀孕时出现孕酮比较低，有可能会导致先兆流产或者是胚胎停止发育，这时也是需要口服孕激素、地屈孕酮或者是黄体酮，也可以应用肌注的黄体酮，也可以使孕酮升高。
但是，怀孕以后如果出现孕酮偏低，绝大多数是由于胚胎发育不正常的原因，也就是不能够有效地刺激黄体产生孕酮，如果是这种现象，有可能会出现先兆流产或者是胚胎停止发育。