1.部位。萎缩性胃炎发生在胃黏膜处，胃窦炎发生在胃窦部位。
2.症状。胃窦炎的患者，一般会出现上腹部钝痛，或者压痛、腹胀、食欲下降、腹泻等症状。萎缩性胃炎，一般多会出现上腹痛、腹胀、餐后饱胀感、焦虑等症状。
3.治疗方法。胃窦炎一般需要服用抑制胃酸、保护胃黏膜、促进胃动力、抗抑郁药物治疗。萎缩性胃炎除了上述药物外，必要时还需要服用消化酶抑制剂。
4.手术。胃窦炎一般不需要进行手术，但是萎缩性胃炎严重时，可以在内镜下治疗或者是手术治疗。