小孩基因突变一般不能治疗。只能根据基因突变引起的相关临床表现进行对症治疗，缓解症状，提高小儿的生活质量和生活能力，尽量的延长其寿命并且减少并发症的发生几率。
因为小孩儿基因突变是基因水平上发生的一种突变，目前没有对于基因有效的治疗方法。需要注意的是基因突变的诱发因素可能是先天的也可能是后天的。
基因突变进展得较为缓慢，很长一段时间才能够发现，所以在怀孕期间和宝宝出生后都要定期的体检，及时排查小儿是否出现基因突变的情况。