基因突变和肠息肉有一定的关系。部分的肠道息肉，如肠道腺瘤样息肉，可能是因为基因突变引起。
引起肠道息肉的原因有很多，如熬夜、精神压力大、疲惫以及高蛋白、高脂肪、大量饮酒等，都可刺激肠道产生息肉。进食辛辣、刺激性的食物或肠道慢性炎症刺激等，都有可能会产生炎性肠道息肉。
习惯性便秘患者，粪便内的毒素会刺激肠道粘膜产生息肉。当基因突变或者遗传等因素，都可导致肠道多发性息肉和腺瘤样息肉。其中家族遗传性息肉，最早可能是因基因突变产生的。