小孩子也会得肛周脓肿的，有的甚至是婴儿也得肛周脓肿。
小孩子的肛周脓肿通常是由便秘及腹泻导致，因为便秘与腹泻时，肛隐窝处会受到损伤，而且有污物积存，细菌在肛隐窝处繁殖，从而导致肛隐窝发生感染。炎症会顺着肛腺导管逐渐蔓延，扩散到肛门周围的软组织内及肛周皮下，最终形成肛周脓肿。
小孩子的肛周脓肿如果感染症状不是很严重，不建议进行手术治疗，最好先给予抗菌药物口服或静脉滴注，如果感染症状得到有效控制，肛周脓肿会被治愈。如果感染不能被控制，就需要考虑进行手术治疗。