无菌性脑膜炎的治疗，首先要明确具体的病因，进一步的明确诊断，明确病因后根据病因再进行相应的治疗。
病毒性脑膜炎一般只要给予支持对症的处理，患者多休息一段时间之后，可以自己康复。结核性脑膜炎的治疗，早期、联合、足量、长期的使用抗结核药物，是治疗的关键。还要结合全身支持治疗、并发症的防治，以及对症治疗。
隐球菌性脑膜炎的治疗比较困难，经常病情加重，死亡率较高。抗真菌治疗是关键，要定期用药，即使临床症状消失、脑脊液化验正常，还要连续三次复查脑脊液都没有隐球菌后，才能考虑停药。药物中毒或者脑肿瘤引起来无菌性脑膜炎，主要是针对原发病进行相应治疗。