基底动脉开窗畸形是比较少见的，是一类原始动脉发育不良，可能引起脑部血流动力学异常，从而引起脑血栓形成。
临床上基底动脉开窗畸形后，导致的脑干梗死、小脑梗死、枕叶和颞叶梗死较为多见。患者常表现头晕、行走不稳、饮水呛咳、吞咽困难，严重时可引起昏迷、危及生命。基底动脉开窗畸形一般血流速度正常，轻度情况不会引起相关症状。
介入治疗和外科治疗不能纠正这种畸形，需要控制糖尿病、高脂血症、吸烟、肥胖等危险因素，治疗相关基础疾病，降低中风风险。