胰石症对身体危害大小和胰石症的大小，以及胰石症存在的部位有关。
如果胰石症比较小，对胰腺的刺激程度也比较轻，不会导致胰腺出现明显的炎症，胰石症对人体的危害就比较小。如果胰石症的体积比较大，对胰腺的刺激程度也比较重，可能会发生反复的炎症，还有可能会对胆管造成压迫，导致患者出现黄疸。
较大的结石对人体的危害比较大，患者的病情也相对较重，少数患者甚至会发生急性的胰腺炎，危及到患者的生命安全。