直肠类癌和直肠癌的细胞来源不同，直肠类癌的主要成分是类癌细胞，直肠类癌的恶性程度相对较低；而直肠癌的细胞是真正的癌细胞，细胞主要来源于直肠粘膜上皮， 直肠癌的危险性要高于直肠类癌。
直肠类癌和直肠癌的临床表现不同，二者虽然都可以表现为直肠的肿物，但是直肠类癌具有内分泌的功能，可以分泌5-羟色胺，此激素可以导致患者出现颜面潮红的症状，有些患者还可以伴有严重的腹泻，少数患者还可以出现哮喘的症状。
二者的治疗方式略有差异，直肠类癌手术切除后基本可以治愈，直肠癌手术后需要给予放化疗，治疗不及时可以危及生命。