流感嗓子痛咳嗽时，要根据原因选择相应的药物治疗。
如果是单纯的流感引起咽喉炎而有嗓子痛，此类患者在口服奥司他韦胶囊抗流感病毒的同时，多需要联合润喉药物，例如蒲地蓝消炎口服液等，缓解咽喉疼痛。此时也要多喝些温水，避免吃辛辣刺激食物。如果流感继发肺炎而有咳嗽，例如并发细菌性肺炎则需要使用抗生素消炎治疗。对于继发病毒性肺炎在抗病毒同时加强对症处理，可口服复方福尔可定口服液或复方甘草片等止咳，部分患者还可以联合雾化等对症处理。
故流感嗓子痛咳嗽时，多需要予以相应的抗感染、润喉、止咳等药物治疗。