早上起来头痛，可能是晚上睡眠不足所引起。如果睡觉前过度熬夜，或者是睡觉过程中总是睡不踏实，容易反复醒来，导致睡眠不足，致使大脑不能得到足够的休息和调整，就可引起晨起时头痛。
也可能是由于早上起来血压高所引起。因为大部分人在早上血压值为高峰期，如果血压升高，就可引起早上起来头痛。
此外，也可能是颈椎病所引起。如果患者在晚上睡觉姿势不当，导致局部神经根遭受压迫，容易对头部神经造成牵扯，也会引起早晨起来头痛。