大便肛门疼治疗的方法，需要结合引发肛门疼痛的原因。常见的原因有以下几个：
第一，肛裂是最常见的原因，是因为患者肛管皮肤开裂所引发。患者局部可以使用痔疮膏或者利多卡因凝胶，缓解局部疼痛症状。伴有便秘的患者，需要口服润肠通便的药物，保持排便通畅。
第二，痔疮，当痔疮出现血栓形成或者引起水肿时，也会导致大便肛门疼痛症状，患者可以口服地奥司明，外用痔疮膏，配合温水或者温盐水坐浴，缓解疼痛症状。
第三，肛周感染性的疾病，例如肛窦炎、肛周脓肿，也会导致大便肛门疼痛的症状。需要使用抗生素控制局部的炎症，必要时需要进行手术治疗。