单心室患者一经确诊，建议进行手术治疗。而手术方式的选择，主要依靠单心室病理解剖，以及患者的病理生理情况来决定。大致的手术方式分为以下几种：
一、肺动脉分流术或者肺动脉环缩术。这两种手术方式都是为了减少肺的血流量，而改善患者呼吸困难、胸闷等症状。
二、心室排外手术。就是使肺循环与心室中的血液直接从心房进入肺动脉，而使得心室直接供应体循环。
三、心室分隔术。就是将心室一分为二，恢复正常的生理结构，但是这种手术方式，目前效果不满意。