宝宝胃肠性感冒要服用一些中成药，改善头痛、流鼻涕、鼻塞、扁桃体的肿大的症状，如连花清瘟颗粒、板蓝根冲剂。
如果出现腹痛、腹胀、恶心、呕吐，可使用一些胃黏膜保护剂，呕吐明显时可使用一些止吐药物。如果出现腹泻，可进行补液止泻处理。
合并细菌感染导致感染性腹泻，会出现发烧、头痛，要根据大便培养药敏的结果，选择一些对儿童副作用小的抗生素，如阿奇霉素、青霉素类、头孢类的抗生素，积极的抗炎抗感染治疗。