结肠炎的病理改变主要集中在结肠，而普通肠炎可存在于肠管的各个部位。两者表现出的症状以及严重程度都不相同。
普通肠炎的患者会有腹部的疼痛，但一般并不剧烈，而且腹泻的症状通常没有结肠炎患者严重。
结肠炎的病人会出现严重腹泻，并且排出脓血便。而且结肠炎的病人并发症比较多，例如中毒性巨结肠、肠管穿孔、大出血等，相较于普通的肠炎风险更高。
在治疗上结肠炎的治疗也比肠炎要复杂，结肠炎的病人通常需要进行系统治疗，严重的还可能进行手术。