上颌窦囊肿手术摘除后，需要将摘下的组织送病理检查，明确病变。
上颌窦囊肿药物治疗效果差，一般采取手术治疗。通常是在鼻内镜下做鼻窦开放术联合囊肿摘除手术。手术后患者有鼻部胀痛不适，鼻腔血性分泌物溢出，术后给予抗生素抗感染以及止血药物。鼻部可使用糖皮质激素抗炎消肿，若仍有出血倾向，可以使用血管收缩剂止血。
患者需要定期到医院进行鼻腔清理，防止鼻腔粘连。患者要清淡饮食，预防感冒。