怀孕6周出现了褐色的分泌物考虑是不正常。首先需要及时做B超检查确定是否宫内孕，如果通过B超检查看到孕囊就可以确定是宫内孕。有褐色分泌物考虑是先兆流产引起的，要抽血检查孕酮和血HCG。
先兆流产需要遵医嘱服药物保胎治疗，卧床休息，严禁劳累和性生活。保胎治疗后需要复查胚胎发育情况是否正常，只要胚胎发育正常，没有再出现增多影响不大。
如果在怀孕前就患有宫颈糜烂、宫颈息肉等疾病也可能会有不规则出血，所以还需要检查是否妇科炎症引起的褐色分泌物，要确定原因治疗。