对于比较小的腹膜后脓肿，可以使用强有力的抗生素进行治疗。一般是联合使用两种消炎药进行治疗，量一定要足，使用的周期也要比较长，有一些患者可以治愈，而对于腹膜后脓肿比较大，则可能需要进行手术切开引流，排脓治疗。
术后可能要放置引流管，并且持续性的冲洗，加强营养，促进疾病的愈合。
另外，患者腹膜后脓肿，一定要检查寻找原发病灶，引起的腹膜后脓肿的病因，并治疗原发病灶，这对于患者的疾病的治疗是非常重要。