在临床上逆行射精应该与以下两种疾病相鉴别。
第一，射精无力症，这种疾病是指协助射精的肌群收缩无力，不能把精液射出体外，而潴留在尿道，其特点是性欲和性交时阴茎勃起均正常。性生活时有性高潮和排精动作，但精液不能射出。在性交后排尿时尿液出现以前有精液流出，实验室镜检尿液和精液分界清楚，中段尿和全程尿，均不能发现精子。
第二，不射精症，不射精症多属精神因素所为，对性生活的不正确认识，害怕怀孕等原因。在性生活中，阴茎可长时间持续勃起，性交时间很长，一直无性欲高潮出现，也无射精的感觉，但有人可能在夜里会出现梦遗的现象。