预防寄生虫病要积极的控制传染源，如对疫区的患者和家畜进行普治、普查，如并殖吸虫病的患者要彻底治愈。对于病猫、病犬等家畜也要积极治疗。调查管理动物传染源，普查对人类有害的保虫宿主动物，不生食溪蟹、蝲蛄等动物。
切断传播途径方面，如预防血吸虫，要消灭钉螺，改变钉螺孳生环境，预防并殖吸虫，不生食溪蟹、蝲蛄，不生饮溪水、不随地吐痰。
预防华支睾吸虫病要加强粪便及水源管理，不随地排便，不在荷塘上、河旁边建厕所。保护易感人群要加强卫生宣教，改变不良的卫生习惯，不生食淡水鱼、虾等。