甲状腺相关的疾病可以导致脖子两边疼。可以导致脖子两边疼最常见的甲状腺的疾病是亚急性甲状腺炎，亚急性甲状腺炎不仅可以出现脖子疼痛不适，还可以出现发烧等全身症状。
亚急性甲状腺炎的治疗，通常是对症治疗，因为它是一种自愈性的疾病，临床上不需要进行特殊的干预和治疗，常用的药物有非甾体类药物，比如双氯芬酸钠。使用非甾体类药物治疗效果欠佳，有些时候根据病情的需要，还会再用强的松等激素类的药物进行对症止痛、退烧治疗，其他甲状腺相关的疾病比较少出现颈部疼痛。
而桥本甲状腺炎、Graves病这些疾病一般都不会出现颈部疼痛的情况。