脸上长出黑色的扁平疣，主要是由于患者的免疫力功能下降所导致的。
扁平疣是一种人类乳头瘤病毒感染所导致的疾病，当人体的免疫力低下时，病毒会通过种植的方式感染患者的皮肤，形成局部的表皮增生，也就是扁平疣。长出黑色的扁平疣可能是由日常的摩擦所导致的，主要用手去抓挠，就会增加对扁平疣的摩擦，而导致形成黑色的病变。
如果黑色的扁平疣比较小，这样的患者可以进行先保守治疗，局部外涂一些去疣的药膏或者是干扰素类的药物进行涂擦患处。如果病情严重，则可以配合进行激光或者是冷冻的方式去除疣体等物理治疗。