冠状动脉瘤无论是单纯性还是继发于冠状动脉瘘，一经并确认之后都需要手术治疗。
对于川崎病所导致的冠状动脉瘤，一般不需要手术，可以应用阿司匹林和感冒球蛋白治疗，可取得显著的效果。冠状动脉瘤手术需要在低温外循环下进行，行动脉瘤切除，或者瘤体两端结扎，用大隐静脉，或者颅内动脉搭桥。对于并发急性冠状动脉血栓形成的心肌梗死的患者，可采取溶栓治疗的方式，经冠状或者是经静脉内注射链霉激素或者尿激酶溶解血栓。血栓治疗效果不满意的话，这个时候可以采取手术治疗的方式。