肠炎导致的腹痛需要根据引起肠炎的不同病因，采用不同的治疗方式，在临床上出现肠炎通常包括细菌性肠炎和自身免疫性肠病所引起的肠炎。
一般多数是细菌性肠炎，通常发生在夏秋季节进食不洁食物以后所引起的，其典型的临床表现为腹痛、腹胀甚至伴有腹泻、粘液脓血便，主要是因为肠道菌群紊乱，通常采用抗生素治疗，一般细菌性肠炎通过3到5天的抗感染治疗以后，就可以获得症状的缓解与治愈。
在临床上比较棘手的是自身免疫性肠病所引起的肠炎，通常自身免疫性肠病包括溃疡性结肠炎以及克罗恩肠病，一般通过需要通过内镜检查以明确诊断，诊断溃疡性结肠炎和克罗恩肠病明确后，通常采用对症治疗以及口服美沙拉嗪，抑制自身免疫性肠病，从而达到缓解结肠炎的症状。