腹泻的治疗主要以药物为主。腹泻的原因比较复杂，需要先找出引起腹泻的原因，去除致病的因素，避免症状加重。
不注意饮食，摄入了被污染的食物，导致肠蠕动加快引起的腹泻，需要结合医生的意见给予抗感染的药物，常见的有青霉素、头孢类的药物。如果大便次数过多或出现水样腹泻，还需给予止泻类的药物，比如蒙脱石散，止泻的同时还能保护肠道的黏膜。
腹泻还伴有发热的症状，精神状态比较差，可通过静脉补液纠正水电解质紊乱，必要时给予双歧杆菌等药物，可以纠正肠道菌群失调。