小儿腹泻发烧根据不同的病因服用不同的药物。
如果是感冒病毒侵犯机体，使全身产生炎症反应导致的，要服用一些抗病毒药物，如奥司他韦颗粒，也可服用一些中成药如板蓝根冲剂、连花清瘟颗粒对症处理。同时，多喝温开水，多吃新鲜的蔬菜和水果。发烧体温超过39℃，可服用一些比较温和的退烧药物。身上出汗比较多时，及时地把汗液擦干。
如果是合并细菌感染出现的腹泻、发烧，要根据大便培养药敏的结果，选择一些对儿童副作用小的抗生素，如青霉素类、头孢类的抗菌药物进行治疗。