经期是否可以做核磁共振要看具体做什么部位的磁共振。如果是非子宫的磁共振检查，无论是否在月经期，都是可以做磁共振检查的。而如果要看子宫病变，最好要避开经期。
另外，乳腺的磁共振检查也最好在月经后的7~10天做，这个时候更有利于乳腺病变的观察。其他部位的检查，就和是否在月经期无关，只要检查前了解好患者的基础情况，看体内是否有心脏起搏器、金属支架等。
如果没有磁共振的禁忌证就不受经期的影响，什么时候都可以做。